工伤住院后流程如下：
1、向有关部门申请工伤认定，并提交资料，包括工伤认定申请表、劳动关系证明、诊断书；
2、有关部门收到申请之后，对资料进行审核；
3、有关部门根据提交的资料以及实际情况做出是否认定为工伤的决定。
申请工伤鉴定的流程如下：
1、当事人到市、县、区劳动和社会保障局提出鉴定申请并填写工伤申请认定表，提交当事人在所在企业盖章同意伤者进行工伤认定的《工伤认定决定书》、完整的病历资料等材料；
2、由劳动能力鉴定委员会审核，对于符合条件申请，鉴定委员会在60个工作日内做出结论；对于材料不完整的，劳动能力鉴定委员会在收到劳动能力鉴定申请之日起5个工作日内，书面告知申请人补全材料；
3、鉴定完成后，相关机构出具鉴定结论，鉴定结论作出后，将在20日内将劳动能力鉴定结论及时送达工伤职工及用人单位， 根据工伤鉴定结果，伤者可以得到因工伤引起的有关损失补偿。
综上所述，一般都会由单位申请，也可以由工伤职工申请，但鉴定必须本人到场。
【法律依据】：
《工伤保险条例》
第十四条 职工有下列情形之一的，应当认定为工伤：
（一）在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的；
（二）工作时间前后在工作场所内，从事与工作有关的预备性或者收尾性工作受到事故伤害的；
（三）在工作时间和工作场所内，因履行工作职责受到暴力等意外伤害的；
（四）患职业病的；
（五）因工外出期间，由于工作原因受到伤害或者发生事故下落不明的；
（六）在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的；
（七）法律、行规规定应当认定为工伤的其他情形。
