年底奖金计算个人所得税扣除标准：
1、发放年终奖的当月工资高于5000元时，年终奖扣税方式为：年终奖*税率-速算扣除数，税率是按年终奖/12作为“应纳税所得额”对应的税率；
2、当月工资低于5000元时，年终奖个人所得税=（年终奖-（5000-月工资））*税率-速算扣除数，税率是按年终奖-（5000-月工资）除以12作为“应纳税所得额”对应的税率。
全年一次性奖金单独计算个人所得税，可以按照以下步骤计算：
1、计算换算后的全月应纳税所得额。以全年一次性奖金收入除以12个月得到的数额，为全月应纳税所得额；
2、确定适用税率。按照按月换算后的综合所得税率表，确定适用税率和速算扣除数；
3、单独计算纳税。计算公式为：应纳税额=全年一次性奖金收入*适用税率-速算扣除数。
综上所述，缴纳税款是作为纳税人应尽的义务，国家的税收都是取之于民用之于民的，年终奖也是要进行缴纳税款的。
【法律依据】：
《中华人民共和国个人所得税法》第二条
下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
（一）工资、薪金所得；
（二）劳务报酬所得；
（三）稿酬所得；
（四）特许权使用费所得；
（五）经营所得；
（六）利息、股息、红利所得；
（七）财产租赁所得；
（八）财产转让所得；
（九）偶然所得。
居民个人取得前款第一项至第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税
